根据国家重点学科及实验室、省部级重点学科及实验室、博士点、院士、长江学者、国家杰青、国家人才计划、论文数量、博导数量、附属医院实力综合评价(括号里为主要闻名附属医院)。
1. 清华大学北京协和医学院(北京协和医院、阜外心血管病医院、肿瘤医院)
2. 北京大学医学部(人民医院、第一医院、第二医院、积水潭医院)
3. 复旦大学上海医学院(中山医院、妇产科医院、华山医院)
4. 上海交通大学医学院(瑞金医院、仁济医院、新华医院、上海六院、上海九院)
5. 华中科技大学同济医学院(同济医院、武汉协和医院、梨园医院)
6. 中山大学中山医学院(中山一院、中山二院、中山三院肿瘤医院)
7. 四川大学华西医学中心(华西医院、华西妇产儿童医院、华西口腔医院)
8. 第二军医大学(长征医院、长海医院、东方肝胆医院)
9. 第四军医大学(唐都医院、西京医院、口腔医院)
10. 第三军医大学(西南医院、新桥医院、大坪医院)
11. 中南大学湘雅医学院(湘雅一院、湘雅二院)
12. 北京中医药大学(东直门医院、护国寺中医医院)
13. 浙江大学医学院(浙医一院、浙医二院、邵逸夫医院)
14. 中国医科大学(盛京医院、中国医大一院、中国医大四院)
15. 南方医科大学(南方医院、珠江医院)
16. 首都医科大学(同仁医院、宣武医院、安贞医院、佑安医院)
17. 哈尔滨医科大学(附属一院、二院、肿瘤医院)
18. 广州中医药大学(第一附属医院、第二附属医院)
19. 吉林大学白求恩医学部(白求恩第一医院、白求恩第二医院、白求恩第三医院)
20. 山东大学医学院(齐鲁医院、山大二院、省立医院)
21. 西安交通大学医学院(第一医院、第二医院、中日联谊医院)
22. 重庆医科大学(第一医院、第二医院、儿童医院)
23. 天津医科大学(总医院、医大二附属医院、肿瘤医院)
24. 武汉大学医学院(湖北省人民医院、中南医院)
25. 上海中医药大学(曙光医院、龙华医院、中医医院)
26. 南京大学医学院(鼓楼医院、南京军区总医院)
27. 南京医科大学(第一附属、第二附属医院)
28. 汕头大学医学院(第一附属、第二附属,附属肿瘤医院)
29. 山东中医药大学(第一附属、第二附属医院)
30. 青岛大学医学院(青岛大学医疗集团)
31. 河北医科大学(附属第一医院、第二医院)
32. 郑州大学医学院(第一附属医院、第二附属医院)
33. 苏州大学医学院(附属第一医院)
34. 安徽医科大学(第一附属医院、附属省立医院)
35. 福建医科大学(附属第一医院、附属第二医院、附属协和医院 )
36. 广西医科大学(附属第一医院、肿瘤医院)
37. 温州医学院(附属第一医院、第二医院)
38. 南京中医药大学(江苏省中医院、第二附属医院)
39. 山西医科大学(附属第一医院、第二医院)
40. 新疆医科大学(第一附属医院、第二附属医院)
41. 兰州大学医学院(第一附属医院、第二附属医院)
42. 大连医科大学(附属第一医院、第二医院)
43. 暨南大学医学院(广州华侨医院、珠海市人民医院)
44. 东南大学医学院(中大医院)
45. 南昌大学医学院(第一附属医院、第二附属医院)
46. 昆明医学院(第一附属医院、第二附属医院)
47. 同济大学医学院(上海十院、同济医院)
48. 广州医学院(第一附属医院、第二附属医院)
49. 广东医学院(广东医学院附属医院)
50. 新乡医学院(新乡医学院第一附属医院)
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