根据2016全国二本大学排名，福建共有16所二本大学参与2016福建二本大学排名，其中排名第一的是福建农林大学，排名第二的是华侨大学，排名第三的是集美大学，以下是2016福建二本大学排名列表，供大家参考！（注：括号内为全国排名。）特别说明，某些院校在河南省内是一本招生，但在其它省份是二本招生的，在此也归为二本院校。
1、福建农林大学（133）——农林
2、华侨大学（164）——综合
3、集美大学（268）——综合
4、福建医科大学（279）——医药
5、福建中医药大学（359）——医药
6、福建工程学院（396）——理工
7、厦门理工学院（404）——理工
8、闽南师范大学（421）——师范
9、闽江学院（448）——理工
10、泉州师范学院（509）——师范
11、三明学院（546）——综合
12、龙岩学院（566）——师范
13、福建江夏学院（581）——财经
14、莆田学院（589）——综合
15、宁德师范学院（636）——师范
16、武夷学院（645）——师范
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